Existem diferentes tipos de cisto, de acordo com a localização em que eles podem surgir:

Pele: um dos mais aparentes. Pode ser classificado de duas maneiras: epidermoides, que consiste em uma formação de queratina da pele; e sebáceos, que, como o nome sugere, ocorrem dentro das glândulas sebáceas. Pode afetar a nuca, as costas e até mesmo o couro cabeludo;
Joelhos: se forma atrás da dobra do joelho, fazendo com que a articulação de movimento fique inchada. Costuma estar relacionado à artrose;
Pulsos: também chamado de cisto ganglionar, é um acúmulo de líquido nas articulações dos braços. Pode também afetar os dedos das mãos;
Mamas: afeta os nódulos mamários e pode ser detectado por meio de um exame de mamografia ou ultrassom;
Ovário: outro tipo conhecido de cisto, ele ocorre ao redor do folículo ovariano e, quando benigno, costuma desaparecer após três meses;
Rins: os cistos renais, também chamados de solitários, são alguns dos mais recorrentes. Por terem origem genética, costumam ser passados entre gerações. Afetam os rins, mas dificilmente causam sintomas graves.