Dentre os efeitos colaterais conhecidos da nimesulida estão:

Dor de cabeça;
Tontura;
Sonolência;
Desconforto gastrointestinal;
Náusea;
Descamação da pele;
Desconforto abdominal;
Diarreia;
Inchaço;
Hipersensibilidade (broncoespasmo, rinite e angioedema);
Vermelhidão da pele.

No início da década de 2000, o remédio foi alvo de preocupações após ter sido associado a casos de desenvolvimento de lesões hepáticas. Porém, de acordo com estudos feitos pela Agência Europeia de Medicamentos (EMA), a situação foi ocasionada pelo uso prolongado do medicamento. Assim, a EMA passou a recomendar que a nimesulida fosse receitada apenas para tratar quadros agudos.